《轩辕剑五》三部曲由正传《一剑凌云山海情》、外传《汉之云》、《云之遥》构成。游戏发售时间顺序为正传《一剑凌云山海情》、外传《汉之云》、外传《云之遥》，按照故事时间线发展的话倒序即可。在笔者看来，《轩辕剑五》三部曲每部单独开来都不是《轩辕剑》系列游戏中最好的，但是合并起来，却构建了一个最为恢宏的剑的传说。
云之遥汉之云一剑凌云山海情皇甫朝云、皇甫暮云兄弟是上古十大神器之“最强力量—轩辕剑”转世，神器一体双生，降生在风雨飘摇、时局动荡的东汉末年。兄弟二人上有一姊，他们的父亲战死沙场，母亲带领姊弟三人迁居外地，后因战火波及，一家人再度流离失所，逃难期间母亲亡故，皇甫朝云为给姐姐和弟弟留下更多食物独自离开。自此兄弟二人失散，走上了截然不同的人生。
哥哥朝云因幼时独自流浪期间不经意爆发出惊人的轩辕剑气，被蜀军发现并收养，后成为了蜀汉赵云徒弟，在师父赵云的悉心教导下成为蜀汉神秘部队“飞羽”天干十杰之首。
皇甫朝云弟弟暮云和姐姐在逃难期间遭遇狼群，姐姐不幸遇难，暮云也在无意识间爆发剑气，消灭掉狼群，然而在外界力量的干预下，原有意识被他人从本体驱逐，依附在狼尸上。暮云本体则诞生了一个没有任何记忆的新意识，犹如痴儿一般，孤苦流浪，后被身处大魏都城洛阳的徐庶收养，成为徐家三公子。稍大后成为魏国名将张郃弟子，在一系列机缘下先于哥哥朝云开发出全部自身剑气，后成为大魏神秘部队“铜雀尊者”中的“白衣尊者”。
皇甫暮云至于依附于狼尸的暮云原有意识，则与狼尸融合化为金色妖狼。具备原有意识的金色妖狼为夺回身体，不断袭击具有新意识的暮云，后随着剧情发展与本体再度融合，暮云记忆完全恢复。
也就是说贯穿《轩辕剑五》三部曲中很长一段时间，轩辕剑全部剑气分为三部分—哥哥朝云、具备全新意识的弟弟暮云、拥有早期暮云意识的金狼。
（当然游戏中如诸葛亮、耶亚希、疆梧等都曾经被动拥有轩辕剑气，此处直接排除。）
长大的朝云和暮云分属不同的阵营，各为其主，在命运的驱使下站上了对立面。
朝云和暮云朝云处事沉着、冷静，能够主动反思战争，心怀天下，有极强领导力，颇有侠之大者之风范。
暮云处事则更为凌厉，有时会被个人情感左右，但是重情重义，一诺千金，更像快意恩仇的剑客。
在我看来，这对超凡双生于世间的存在就像是理性与感性的冲击，也许这样，当他们合为一体时才是那无暇完美的最强神兵轩辕剑。
超凡双生—朝云和暮云朝云对于战争的认知是循序渐进的，这个转折点便是白柳砦任务，任务中他用失散姐姐的蓟花耳饰作为礼物从一个小女孩口中套取情报，小女孩开心戴上耳饰，并毫无戒心地告知了朝云需要的情报。朝云率众成功闯入白柳砦，剿灭了里面的“魏贼”。后清点用来计算战功的敌耳时，赫然发现戴有耳饰的耳朵，这才得知此役手无尺铁的老弱妇孺尽皆死于己方兵刃之下，自这时起，便渐渐开始反思战争的意义，质疑自己曾经坚守的信仰是否正确。
与同伴战斗的朝云至于暮云对于战争认知自始至终都能用“单纯”一字形容。他为大魏而战，为友谊而战，为保护身边至亲之人而战。当最好的朋友柏乔被蜀国高手杀死后，他便更坚定了这种信念。应该说他对于战争并没有过多反思与质疑，即使有片刻犹豫，也是出于内心的善。
暮云与同伴诸葛亮第五次北伐时，蜀国国力虽有一定恢复，但发动战争自然会劳民伤财，最重要的是不管是蜀国还是魏国，无辜的百姓都不得安享太平。
朝云的战争认知已彻底转变为反战，在师父赵云（游戏中曾使用假死之术，后复活，历史上的赵云在第三次北伐便与世长辞）的授意下临阵倒戈，意图刺杀诸葛亮，结束第五次北伐，结束战争，还天下百姓一个太平。
暮云因为对义父徐庶的承诺，主动保护义父的挚友诸葛亮。兄弟二人最终反转了立场，却又站上新的对立面。
（其实《轩辕剑五》两部外传，特别是《汉之云》的战争观和历史观，很容易遭受质疑和非议，即使我认可游戏本身，也不能认同其中诸多观念，权当是一种另类的解读吧！）
兄弟二人出于各自的信念，最终在五丈原兵戎相见，展开了一场旷世之战。我们无法定义这场战斗谁胜谁负，毕竟《汉之云》结局和《云之遥》的五丈原篇展现的有所不同，但这些都不重要，此战之后，兄弟二人合二为一，他们组成了完整的轩辕剑，将不再有国家之分，善恶之别。唯有各自游历人间的真情与眷顾铭刻在这个全新身体的记忆里。
弟弟暮云哥哥朝云双生合体暮云占据更多的剑气比重，能感受天女的感召，二人合体后，由暮云主导意识，去往山海界，开启了《一剑凌云山海情》中拯救天女的旅程，与三国时代没有了关系，亦不再是主角，在此不再赘述。
这对超凡双生除了带给我们他们个人的悲壮故事外，通过他们的双眼也为我们铺陈了时代的悲怆。
东汉末年，群雄逐鹿；折戟沉沙，三分天下；沧海横流，名宿辈出。端的是令人神往。可是逝水东流，英雄迟暮，终会成为淹没于历史长河中的浪花。
滚滚长江东逝水在不可逆转的时代变局下，当局之人犹如凝视深渊，随时会被深渊吞噬。“鞠躬尽瘁，死而后已”，在时代浪潮的裹挟下竟似映射出深深地无力感。即使强如上古神器轩辕剑，在滚滚历史洪流下也如同一叶扁舟。
“鞠躬尽瘁，死而后已”历史，向来记诵涌立时代潮头的王侯将相，将籍籍无名的芸芸众生拒之门外。
诸葛亮和周瑜羽扇纶巾，谈笑间，樯橹灰飞烟灭。而朝云、暮云兄弟二人的父亲作为万千士兵之一在赤壁战火中殒命。
火烧赤壁关羽攻襄阳、樊城，时“汉水溢流，害于民”，致曹魏水淹七军，关羽趁机率军重创曹魏，威震华夏。带来的则是兄弟二人再度流离失所。
襄樊之战人们喜好讨论金戈铁马、成王败寇，鲜有人会去
